亚马逊买家选了second day shipping，但运费没付够，怎么办？

你就按买家选的方式发货，不要取消订单了。吃亏一下，当作破财免灾

既然买家能下单成功，那就说明他是根据订单页面显示的运费付钱的。应该不是他钱没付够

我是觉得有两种可能性，不知道楼主说的是哪一种？
1. 买家下单时，选速度较慢的发货方式（比如Standard Shipping），后来又要求快一点的（2 day shipping）：这种情况，你可以让买家取消订单（可能他不肯，那你取消，然后道歉），再重新下单；
2. 楼主，你自己要出的运费很高，亚马逊给的赔偿不足以弥补你的“损失”：这种事其实挺正常的，你只能吃亏了。但是你可以适当地调整商品价格。

你取消订单或不选second day shipping的话，不但对账户指标有影响（late delivery/order cancellation），而且买家可能会给差评或要求退运费。所以还是按要求发货吧

既然买家下单了，不管你有没有取消，他都是可以留评的。
楼主你正常发货（按买家选的运送方式），然后重新评估，考虑一下哪些商品适合2-day shipping，哪些商品不适合。