马德里商标和欧盟商标各有各的优势，如果企业只需要在欧盟成员国寻求商标权利的保护，建议选择申请欧盟商标，如果需要在更多的国家进行商标注册，通过马德里申请是非常不错的选择。

马德里国际注册体系受两个条约约束：1891年签订的《商标国际注册马德里协定》和1989年通过的《商标国际注册马德里协定有关议定书》。两条约的目标是为商标所有人简化行政程序，使其能在最短时间内以最低成本在所需国家里获得商标保护。目前有成员国99个。 马德里商标最大的特点是只需要提交一份申请就可以要求在多个缔约国进行注册。1993年12月20日，欧盟会议通过了《欧洲共同体商标条例》，简称CMTR。欧盟商标局于1996年1月1日开始受理欧盟商标申请。

欧盟商标最大的特点是欧盟商标的申请人不限于欧盟成员国的国民，其他入《巴黎公约》、《世界知识产权组织》成员国的国民也可以提出申请。欧盟商标保护期限为10年，可续展，每次续展保护期限为10年，注册后将在欧盟各个成员国受到相应的法律保护。

1、保护范围不同

马德里商标保护的范围以申请人指定的国家为准。申请人可以指定1个国家，也可以指定全部成员国。但是，每指定一个国家，就要承担相应的费用。 欧盟商标是无论你在28个成员国之中的哪一个国家注册商标，你的商标都将受到这27个国家的保护。 欧盟成员国：德国、法国、意大利、比利时、卢森堡、丹麦、瑞典、西班牙、葡萄牙、芬兰、希腊、奥地利、荷兰、爱尔兰、塞浦路斯、捷克、爱沙尼亚、匈牙利、拉脱维亚、立陶宛、马耳他、波兰、斯洛伐克、斯洛维尼亚、罗马尼亚、保加利亚、克罗地亚。

2、申请人资格限制不同

马德里商标的申请人必须是成员国的企业、个人或其他组织，且必须以原属国已申请或注册商标为基础商标，向世界知识产权组织（WIPO）提起申请。也就是说你必须在国内先注册好商标，然后才能申请马德里商标。欧盟商标则没有限制，任何人都可以提交申请。

3、本质不同

马德里商标受保护的国家或地区要相对多一些，一份申请可以指定全部成员国，且申请费用相对于单一国家低一些，在全球使用范围非常广泛，我们所说的“国际商标”指的就是马德里商标。 欧盟注册商标的保护范围仅限于欧盟27国家，但申请流程较为简便且时间相对较短。